A COMERP foi fundada em 1999 por um grupo de profissionais médicos interessados em valorizar a posição dos médicos perante as instituições da área da saúde e como uma alternativa do mercado de trabalho.

Tendo sido constituída com base na Lei 5.764/71 com o objetivo de prestar serviços a diversos segmentos da área da saúde, sempre através da sociedade cooperativa, cujo sistema proporciona maior liberdade para a prestação de serviço, treinamento e desenvolvimento profissional, postos de trabalho e aumento de renda, inclusive com participação nas sobras geradas pela cooperativa.

A COMERP está sediada na cidade de Ribeirão Preto, conhecida nacionalmente como um centro de excelência na área da saúde. O município está entre os primeiros do brasil no ranking na proporção médicos por habitante. São 3 mil médicos, 1 para cada 160 habitantes.